Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms