Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms