Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgaE9PV24 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms