Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif28pD3YXS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms