Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms