Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms