Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms