Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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