Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms