Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smok3bC0HKC9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms