Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptprz1B9EKR1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms