Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmf1B9EKI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms