Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms