Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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