Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms