Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cped1B2RX70 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms