Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms