Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf518bB2RRE4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf518bB2RRE4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms