Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms