Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms