Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms