Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms