Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms