Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gbp4A4UUI3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms