Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr16A3KMN5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr16A3KMN5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms