Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms