Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms