Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms