Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cavin4A2AMM0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cavin4A2AMM0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cavin4A2AMM0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms