Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd7A2AJK6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms