Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lcn6A2AJB9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms