Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms