Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms