Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Trav12-2A0N8N6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trav12-2A0N8N6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trav12-2A0N8N6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trav12-2A0N8N6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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