Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms