Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A0A0U1RNP2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms