Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms