Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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