Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms