Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm4T1NXB5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms