Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms