Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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