Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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