Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms