Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NgfrQ9Z0W1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms