Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc1Q9Z0G0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms