Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms