Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim10Q9WUH5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim10Q9WUH5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim10Q9WUH5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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