Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF3

Casp8ap2, CASP8-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8ap2Q9WUF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8ap2Q9WUF3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8ap2Q9WUF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms