Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms